Ondřej Pokora
Lektor
Masarykova univerzita,
Přírodovědecká fakulta
Ústav matematiky a statistiky,
tým Aplikovaná matematika a statistika
pracovna: areál Kotlářská, budova 08, 3. podlaží, místnost 03016a
telefon: 54949 4598
e-mail: pokora(at)math(dot)muni(dot)cz
MUNI – Lidé
Researcher ID: B-7469-2012
ORCID: 0000-0001-5327-5882
Scopus Author ID: 23991210800
Lecturer
Masaryk University,
Faculty of Science
Department of Mathematics and Statistics,
team Applied mathematics and statistics
office: Kotlarska campus, building 08, 3rd floor, room 03016a
phone: +420 54949 4598
e-mail: pokora(at)math(dot)muni(dot)cz
MUNI – People
Researcher ID: B-7469-2012
ORCID: 0000-0001-5327-5882
Scopus Author ID: 23991210800
Adresa
Ústav matematiky a statistikyPřírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity
Kotlářská 267/2
Brno
611 37
Mailing address
Department of Mathematics and StatisticsFaculty of Science, Masaryk University
Kotlarska 267/2
Brno
CZ-611 37, Czech Republic
Výuka / Teaching
M7111 | Vybrané kapitoly z matematického modelování / Topics on mathematical modelling | interaktivní osnova |
---|---|---|
M81B0 | Matematické modely v biologii / Mathematical models in biology | interaktivní osnova |
M9211 | Bayesovské metody / Bayesian methods | interaktivní osnova |
M9DM2 | Data mining II / Data mining II (část kurzu) | |
MA012 | Statistics II at Faculty of Informatics | interactive syllabus |
MA750 | Teorie pravděpodobnosti / Probability theory | interaktivní osnova |
MF002 | Stochastická analýza / Stochastic analysis | interaktivní osnova |
Závěrečné práce / Theses
Seznam aktuálně vypsaných témat k přihlášení naleznete v autentizovaném ISu na tomto odkazu.
Bakalářské práce
- Ewa Paździorová: Značkovaný Poissonův proces.
- Soňa Sviatková: Predikční model časové řady. (Faculty of Informatics)
- Matyáš Fusek: Stochastické Petriho sítě, 2024.
- Barbora Brodová: Oceňování finančních derivátů, 2023
- Miroslav Ilavský: Frakcionální Poissonův proces, 2023
- Tomáš Petit: Teorie informace a její využití při hodnocení statistických modelů, 2023
- Lucie Mitrengová: Monte Carlo integrování, 2022
- Monika Benovicsová: Stochastické modely síťového provozu, 2022
- Peter Vrťo: Procesy obnovy, 2022
- Veronika Ganzová: Stochastická uspořádání, 2021
- Tomáš Kahoun: Monty Hallův problém, 2020
- Jana Benková: Statistické řízení kvality, 2017
- Marie Langrová: Testování statistických hypotéz, 2017
- Róbert Bačo: Zákon iterovaného logaritmu: od zákonů velkých čísel k centrální limitní větě, 2016
- Júlia Pisárová: Kopuly a korelace, 2016
- Rastislav Rehák: Genetické algoritmy a jejich využití, 2015
- David Vodrážka: Lévyho procesy a jejich aplikace v ekonomii, 2015
- Michal Koláček: Matematické modely rozhodování, 2015
- Rafael Schwarzenegger: Statistické metody pro hodnocení kvality pracovního procesu, 2015
- Vojtěch Šindlář: Limitní věty v pravděpodobnosti, 2014
- Natálie Přikrylová: Hodnocení klienta pro poskytnutí úvěru, 2014
- Karolína Vítková: Cirkulární rozdělení pravděpodobnosti, 2014
- Martin Fila: Grafika v R pomocí knihovny ggplot2, 2013
- Karel Vaculík: Základy teorie informace a statistické entropie, 2013
- Jana Štrosová: Zobecněné a normální inverzní Gaussovo rozdělení pravděpodobnosti, 2012
- Juraj Kapasný: Markovské řetězce a stochastické matice, 2012
- Martin Reiss: Odhady parametrů některých rozdělení pravděpodobnosti a jejich vlastnosti, 2011
Diplomové práce
- Soňa Beluská: Bayesovské sítě.
- Sára Hasíková: Degradační procesy.
- Jiří Mazuch: Bayesovská kvantilová regrese.
- Ján Kršiak: Strojové učení ve finanční matematice.
- Tomáš Salavec: Bayesovské klasifikační metody.
- Monika Benovicsová: Difuzní procesy, 2024.
- Veronika Ganzová: Lévyho procesy ve finanční matematice, 2023
- Viktória Kišková: Modelování úrokové míry, 2023
- Tereza Doležalová: Frakcionální Brownův pohyb a jeho aplikace, 2022
- Jakub Skoupý: Analýza přežití s využitím bayesovského přístupu, 2021
- Tomáš Pospíšil: Kopule: modelování závislostí, 2021
- Jiří Jireš: Difuzní procesy a jejich aplikace, 2020
- Jana Benková: Difuzní procesy se skoky, 2019
- Matúš Horváth: Metody oceňování některých finančních derivátů, 2019
- Júlia Pisárová: Využití kopulí v ekonomii, 2019
- Jan Jekl: Matematické modely neuronu, 2018
- Lucia Macášková: Stochastické procesy v analýze přežití, 2018
- Lujza Gírethová: Oceňování opcí, 2018
- Stanislava Kachmanová: Stochastické modely úrokové míry, 2017
- Ondřej Nováček: Posuzování spolehlivosti elektronického prvku, 2016
- Martin Trebula: Difúzní procesy a jejich aplikace, 2015
- Tomáš Kuric: Hestonův model, 2015
- Martin Diviš: Modely stochastické volatility, 2015
- Marian Koutný: Odhad hustoty metodou maximální penalizované věrohodnosti, 2014
- Lenka Rozbořilová: Dynamické zobecněné lineární modely, 2013
- Matej Vojvoda: Zobecněné aditivní modely v jazyce R, 2013
- Monika Baumgartnerová: Testování statistických hypotéz, 2012
Curriculum Vitae
Mgr. Ondřej Pokora, Ph.D. born February 14, 1981 in Brno, Czech RepublicCurrent position
- since 2018: Lecturer, Department of Mathematics and Statistics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic
Previous positions
- 2013–2018: Assistant professor, Department of Mathematics and Statistics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic
- 2011–2012: Researcher, Department of Computational Neuroscience, Institute of Physiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Praha, Czech Republic
- 2009–2011: Scientific research assistant, Jaroslav Hájek Center for theoretical and applied statistics, Department of Mathematics and Statistics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, Czech Republic
- 2005–2009: PhD student – researcher, Institute of Physiology, Academy of Sciences of the Czech Republic, Praha, Czech Republic
Education
- 2009: Ph.D. (doctoral degree), Probability, statistics and mathematical modelling, Mathematical models in neurophysiology: models of olfactory neurons, Dept. of Mathematics and Statistics, Faculty of Science, Masaryk University, Brno, supervisor Petr Lánský
- 2005: Mgr. (master degree), Mathematical modelling and numerical methods, Distance measurement in microaxial tomography: some mathematical-statistical approaches (in Czech), Dept. of Mathematics and Statistics, Faculty of Science, Masaryk University
- 2003: Bc. (bachelor degree), Mathematics, Iterative methods for solving systems of linear equations (in Czech), Dept. of Mathematics, Faculty of Science, Masaryk University
Teaching activities
- Stochastic analysis
- Bayesian methods
- Probability theory
- Statistics
- Seminar of mathematical models in biology (occasionally)
- Seminar of mathematical modelling (occasionally)
- Random processes (formerly)
- Linear statistical models (formerly)
Stays abroad
- 2008: Dipartimento di Matematica, Università degli Studi di Torino, Torino, Italy, 6 months, advisor Laura Sacerdote, WWS Project
- 2006: l'Institut National de la Recherche Agronomique, Versailles, France, 1 week, ECO-NET
Current scientific topics
- Stochastic models in biology and engineering
- Functional data analysis
Academic awards
- 2010: Prize for the doctoral thesis
- 2009: Prize of the dean of Faculty of Science
- 2006: Prize of Dept. of Mathematics
Other
- mathematical (statistical) software, currently R, Maxima, Mathematica, previous experience Matlab, Maple, Statistica
- typografical system TeX, macro programming, scientific graphs typesetting
- web pages and applications, PHP, HTML, MySQL, CSS, JavaScript
- English, German fluent
Publications
- Vališ D., Pokora O., Koláček J. (2019) System failure estimation based on field data and semi-parametric modeling.Engineering Failure Analysis 101, 473–484. doi:10.1016/j.engfailanal.2019.04.014
- Koláček J, Pokora O, Kuruczová D., Chiu T.-W. (2019) Benefits of functional PCA in the analysis of single-trial auditory evoked potentials. Computational Statistics 34, 617–629. doi:10.1007/s00180-018-0819-6
- Tóth P. G., Maršálek P., Pokora O. (2018) Ergodicity and parameter estimates in auditory neural circuits. Biological Cybernetics 112, 41–55. doi:10.1007/s00422-017-0739-5
- Vališ D., Žák L., Pokora O. (2018) Perspective approach in using anti-oxidation and anti-wear particles from oil to estimate residual technical life of a system. Tribology International 118, 46–59. doi:10.1016/j.triboint.2017.09.017
- Pokora O., Koláček J., Chiu T.-W., Qiu W. (2017) Functional data analysis of single-trial auditory evoked potentials recorded in the awake rat. BioSystems 161, 67–75. doi:10.1016/j.biosystems.2017.09.002
- Vališ D., Žák L., Pokora O., Lánský, P. (2016) Perspective analysis outcomes of selected tribodiagnostic data used as input for condition based maintenance. Reliability engineering & system safety 145, 231–242. doi:10.1016/j.ress.2015.07.026
- Vališ D., Žák L., Pokora O. (2016) System Condition Estimation Based on Selected Tribodiagnostic Data. Quality and Reliability Engineering International 32 (2), 635–645. doi:10.1002/qre.1778
- Vališ D., Pokora O. (2015) Application of selected diffusion processes on system state assessment. In Safety and Reliability: Methodology and Applications - Proceedings of the European Safety and Reliability Conference, ESREL 2014, 911–916. Wroclaw: CRC Press/Balkema.
- Pilarski S., Pokora O. (2015) On the Cramér-Rao bound applicability and the role of Fisher information in computational neuroscience. BioSystems 136, 11–22. doi:10.1016/j.biosystems.2015.07.009
- Wan I., Pokora O., Chiu T., Lánský P., Poon P. W. F. (2015) Altered intensity coding in the salicylate-overdose animal model of tinnitus. BioSystems 136, 113–119. doi:10.1016/j.biosystems.2015.06.010
- Vališ D., Žák L., Pokora O. (2015) Failure prediction of diesel engine based on occurrence of selected wear particles in oil. Engineering Failure Analysis 56, 501–511. doi:10.1016/j.engfailanal.2014.11.020
- Vališ D., Žák L., Pokora O. (2015) Contribution to system failure occurrence prediction and to system remaining useful life estimation based on oil field data. Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part O: Journal of Risk and Reliability 229, 36–45. doi:10.1177/1748006X14547789
- Vališ D., Pokora O. (2015) Estimation of system residual useful life based on selected tribo data. In Industrial Engineering and Engineering Management (IEEM), 2014 IEEE International Conference, 1171–1775. Selangor: IEEE Computer Society. doi:10.1109/IEEM.2014.7058823
- Lánský, P., Pokora, O. (2015) Matematické modely v biologii. In Holčík Jiří, Komenda Martin. Matematická biologie: e-learningová učebnice. 1. vyd. Brno. Matematická biologie učebnice: Matematické modely v biologii
- Lánský, P., Pokora, O. (2015) Vybrané kapitoly z matematického modelování. In Holčík Jiří, Komenda Martin. Matematická biologie: e-learningová učebnice. 1. vyd. Brno. Matematická biologie učebnice: Vybrané kapitoly z matematického modelování
- Vališ D., Žák L., Pokora O. (2014) Engine residual technical life estimation based on tribo data. Eksploatacja i Niezawodnosc – Maintenance and Reliability 16, 203–210.
- Koštál L., Lánský P., Pokora O. (2013) Measures of statistical dispersion based on Shannon and Fisher information concepts, Information Sciences 235, 214–223. doi:10.1016/j.ins.2013.02.023
- Pokora O., Lánský P. (2012) Estimating individual firing frequencies in a multiple spike train record, Journal of Neuroscience Methods 211, 191–202. doi:10.1016/j.jneumeth.2012.09.010
- Koštál L., Pokora O. (2012) Nonparametric estimation of information-based measures of statistical dispersion, Entropy 14, 1221–1233. doi:10.3390/e14071221
- Koštál L., Lánský P., Pokora O. (2011) Variability measures of positive random variables, PLoS ONE 6, e21998. doi:10.1371/journal.pone.0021998
- Pokora O. (2009) Fisher information as the measure of signal optimality in olfactory neuronal neurons, Acta Universitatis Matthiae Belii, Series mathematics 16, 53–63.
- Pokora O., Lánský P. (2008) Statistical approach in search for optimal signal in simple olfactory neuronal models, Mathematical Biosciences 214, 100–108.
- Lánský P., Pokora O., Rospars, J.-P. (2007) Classification of stimuli based on stimulus-response curves and their variability, Brain Research 122, 57–66.
- Pokora O., Lánský P. (2007) Steady-State Properties of Coding of Odor Intensity in Olfactory Sensory Neurons, Lecture Notes in Computer Science 4729, Springer, 360–367.
- Lánský P., Pokora O., Rospars, J.-P. (2007) Stimulus-Response Curves in Sensory Neurons: How to Find the Stimulus Measurable with the Highest Precision, Lecture Notes in Computer Science 4729, Springer, 338–349.
Presentations at meetings, workshops and seminars
- Pokora O., Kolacek J., Stochastické modelování degradace technického systému, ROBUST 2022, Volyně, Czech Republic, 2022.
- Pokora O., Kolacek J., Benefits of the functional data analysis of evokwed potentials, 13th International Neural Coding Workshop, Torino, Italy, 2018, poster.
- Pokora O., Modelování a statistická inference pomocí difúzních a skokových procesů, Workshop Centra pro transfer technologií a PřF MU, Brno, Czech Republic, 2018.
- Pokora O., Kolacek J., Analýza funkcionálních dat záznamů vyvolaných potenciálů ve sluchové dráze, ROBUST 2018, Rybník, Czech Republic, 2018.
- Pokora O., Kolacek J., Chiu T.-W., Functional data analysis in neural processing, 4th International Workshop on Functional and Operatorial Statistics (IWFOS), A Coruña, Spain, 2017, poster.
- Pokora O., Valis D., Application of selected diffusion processes in modelling of system degradation, Olomoucian Days of Applied Mathematics 2017 (ODAM), Olomouc, Czech Republic, 2017, poster.
- Kolacek J., Pokora O., Chiu T.-W., Functional data analysis in neural processing, Olomoucian Days of Applied Mathematics 2017 (ODAM), Olomouc, Czech Republic, 2017, poster.
- Pokora O., Kolacek J., Chiu T.-W., Functional data analysis of the recordings of auditory evoked potentials, 12th International Neural Coding Workshop, Köln, Germany, 2016, poster.
- Pokora O., Kolacek J., Využití regrese a analýzy funkcionálních dat pro vyhodnocení neurofyziologických záznamů, ROBUST 2016, Karlov, Czech Republic, 2018.
- Pokora O., Kostal L., Nonparametric estimations of the interspike interval distribution, 11th International Neural Coding Workshop, Versailles, France, 2014, poster.
- Pokora O., Cykly a paralelní výpočty v R, Seminář z aplikované matematiky, Brno, Czech Republic, 2014.
- Pokora O., Lansky P., Nonparametric estimation of interspike interval distribution and its characteristics, 10th International Neural Coding Workshop, Praha, Czech Republic, 2012, poster.
- Pokora O., Odhad hustoty pravděpodobnosti metodou maximální penalizované věrohodnosti, Seminář z aplikované matematiky, Brno, Czech Republic, 2012.
- Pokora O., Lansky P., On the estimation of the individual firing rates from superposed spike train, European Conference on Mathematical Biology, Krakow, Poland, 2011, poster.
- Pokora O., Lansky P., Individual firing frequencies estimated from superposed spike trains, 9th International Neural Coding Workshop, Limassol, Cyprus, 2010.
- Pokora O., Stochastic modeling of signal transduction in sensory neurons, 6th Summer School of Mathematical Biology, Lednice, Czech Republic, 2010, invited talk.
- Pokora O., Lansky P., Optimal odor intensity in olfactory neuronal models, Computational Neuroscience Meeting 2009, Berlin, Germany, 2009, poster.
- Pokora O., Optimal odor intensity in simple olfactory neuronal models, International Student Conference on Applied Mathematics and Informatics 2009, Malenovice, Czech Republic, 2009.
- Pokora O., Lansky P., Optimal odor intensity in olfactory neuronal models, 7th Conference of the Czech Neuroscience Society, Prague, Czech Republic, 2009, poster.
- Pokora O., Lansky P., Optimal odor intensity in simple olfactory neuronal models, Workshop on Sensory Neuroinformatics, Plzeň, Czech Republic, 2009, invited talk.
- Pokora O., Lansky P., Classification of input signals based on input-output curves, 5th International Conference on Unsolved Problems on Noise and Fluctuations in Physics, Biology & Technology 2008, Lyon, France, 2008, poster.
- Pokora O., O Fisherově míře a její aproximaci – teorie a aplikace v neurofyziologii, Seminář z aplikované matematiky, Brno, Czech Republic, 2008.
- Pokora O., Lansky P., Petr, Steady-State Properties of Coding of Odor Intensity in Olfactory Sensory Neurons, Brain, Vision and Artificial intelligence 2007, Naples, Italy, 2007.
- Pokora O., Lansky P., Optimal odor intensity in simple olfactory neuronal models, BIOCOMP 2007, Vietri sul Mare, Italy, 2007, poster.
- Pokora O., Lansky P., Optimal odor intensity in simple olfactory neuronal models, 6th Conference of the Czech Neuroscience Society, Prague, Czech Republic, 2007, poster.
- Pokora O., Lansky P., Optimal signal in ligand-receptor models, Computational Neuroscience Meeting 2006, Edinburgh, Great Britain, 2006, poster.
- Pokora O., Lansky P., Optimal signal in ligand-receptor models, Prague Stochastics 2006, Prague, Czech Republic, 2006, poster.